L'AERES s'engage à mettre en œuvre une politique d'évaluation fondée sur trois principes : l'indépendance, la transparence et l'impartialité. Elle entend également conduire ses missions en accord avec des valeurs clés, énoncées dans sa charte de l'évaluation.
Nouveau référentiel relatif aux critères d'évaluation des entités de recherche :